Die Schweizerische Initiative für quantitative systembiologische Forschung will sich global in einer Vorreiterrolle positionieren. Die Verknüpfung der verschiedensten Stärken unter anderem der modernen Genomik und der biomedizinischen Forschung zusammen mit den klassischen Disziplinen wie Chemie, Physik und Ingenieurwissenschaften soll die Initiative zu diesem Ziel führen. Systembiologie ermöglicht einen grundlegenden Paradigmenwechsel  in der biologischen Forschung. Die historisch deskriptive Biologie entwickelt sich dadurch zur einer qualitativen und voraussagenden Wissenschaft. SystemsX.ch will diesen Wechsel mittels drei verschiedener Arten fördern. Mittels Entwicklung neuer Technologien werden quantitative biomedizinische Daten gesammelt und analysiert. Durch den Aufbau neuer mathematischer Modelle wird das Verhalten biologischer Systeme simuliert und kann dadurch vorausgesagt werden. Als letztes ist es zentral, dass die richtigen biologischen Forschungsfragen gestellt werden.