Forschungs-, Technologie-, und Entwicklungsprojekte (RTD-Projekte) sind grosse, integrierte Projekte, bei welchen neben der biologischen auch weitere naturwissenschaftliche Disziplinen zum Zug kommen. RTD-Projekte untersuchen vertieft ein biologisches System und/oder entwickeln eine neue Technologie. Diese Technologien sollen ein grosses Potential für zukünftige Anwendungen in der Systembiologie haben.

Jedem RTD-Projekt steht ein Forschungsleiter vor, der für Verwaltung, Koordination und Berichterstattung verantwortlich ist. Um die Ziele eines RTD-Projekts zu erreichen, arbeiten verschiedene Gruppen aus sich ergänzenden Forschungsfeldern zusammen. Besonders erwünscht ist die Zusammenarbeit von Forschern aus bislang weit voneinander entfernten Disziplinen. In der Regel sind mindestens zwei Partnerinstitutionen an einem Projekt beteiligt.